stormm::mm::SystemCache Member List

This is the complete list of members for stormm::mm::SystemCache, including all inherited members.

exportCoordinateSynthesis(int globalpos_scale_bits=default_globalpos_scale_bits, int velocity_scale_bits=default_velocity_scale_bits, int force_scale_bits=default_force_scale_bits) const	stormm::mm::SystemCache
exportTopologySynthesis(const GpuDetails &gpu=null_gpu, const ExceptionResponse policy=ExceptionResponse::DIE) const	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointKind(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCheckpointName(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCoordinatePointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getCoordinatePointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCoordinatePointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCoordinatePointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getCoordinates(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getCoordinates() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getFeatures(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getFeaturesPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getFeaturesPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getFeaturesPointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getFeaturesPointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getFirstMatchingSystemIndex(const AtomGraph *query_ag, ExceptionResponse xcpt=ExceptionResponse::DIE) const	stormm::mm::SystemCache
getFirstMatchingSystemIndex(const std::string &query_label, ExceptionResponse xcpt=ExceptionResponse::DIE) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getFirstMatchingSystemIndex(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label, ExceptionResponse xcpt=ExceptionResponse::DIE) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesKind(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getInputCoordinatesName(int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getLabel(int label_index) const	stormm::mm::SystemCache
getLabelCacheIndex(const std::string &query) const	stormm::mm::SystemCache
getLabelCount() const	stormm::mm::SystemCache
getLabelsMatchingTopology(const AtomGraph *query_ag) const	stormm::mm::SystemCache
getLabelsMatchingTopology(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getMatchingSystemIndices(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const	stormm::mm::SystemCache
getMatchingSystemIndices(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getMatchingSystemIndices(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getMatchingSystemIndices(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getMatchingSystemIndices(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getPrintingProtocol() const	stormm::mm::SystemCache
getPrintingProtocol(CoordinateFileRole purpose, int system_index) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getRestraintCount() const	stormm::mm::SystemCache
getRestraintPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getRestraintPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getRestraintPointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getRestraintPointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getRestraints(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSelfPointer() const	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntry(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntry() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntryPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntryPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntryPointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getStructureDataEntryPointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemCount() const	stormm::mm::SystemCache
getSystemExampleIndex(int topology_index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemForwardMask(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemForwardMaskPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemForwardMaskPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemLabel(int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemLabelIndex(int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemStaticMask(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemStaticMaskPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemStaticMaskPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopology(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyIndex(int coord_index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyIndex() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyPointer(int index) const	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyPointer(int index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyPointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getSystemTopologyPointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTopologicalCases(int topology_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologiesMatchingLabel(const std::string &query_label) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologiesMatchingLabel(const std::string &query_label) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTopology(int topology_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologyCacheIndex(const AtomGraph *ag) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologyCacheIndex(const AtomGraph &ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTopologyCaseCount(int topology_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologyCount() const	stormm::mm::SystemCache
getTopologyPointer(int topology_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTopologyPointer(int topology_index) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTopologyPointer() const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTopologyPointer() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryFusionProtocol() const	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryKind(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(int system_index) const	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(const AtomGraph *query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(const AtomGraph &query_ag) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(const AtomGraph *query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(const AtomGraph &query_ag, const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getTrajectoryName(const std::string &query_label) const (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
getUniqueStaticMaskPointers() const	stormm::mm::SystemCache
getUniqueStaticMaskPointers() (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
operator=(const SystemCache &other)=default (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
operator=(SystemCache &&other)=default (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
setPrintingProtocol(const PrintSituation expectation_in)	stormm::mm::SystemCache
setTrajectoryFusionProtocol(TrajectoryFusion file_merger_protocol_in)	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(ExceptionResponse policy_in=ExceptionResponse::DIE, MapRotatableGroups map_chemfe_rotators=MapRotatableGroups::NO, PrintSituation expectation_in=PrintSituation::OPEN_NEW)	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(const FilesControls &fcon, const std::vector< RestraintControls > &rstcon, const DynamicsControls &dyncon, ExceptionResponse policy_in=ExceptionResponse::DIE, MapRotatableGroups map_chemfe_rotators=MapRotatableGroups::NO, PrintSituation expectation_in=PrintSituation::OPEN_NEW, StopWatch *timer_in=nullptr) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(const FilesControls &fcon, const DynamicsControls &dyncon, ExceptionResponse policy_in=ExceptionResponse::DIE, MapRotatableGroups map_chemfe_rotators=MapRotatableGroups::NO, PrintSituation expectation_in=PrintSituation::OPEN_NEW, StopWatch *timer_in=nullptr) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(const FilesControls &fcon, ExceptionResponse policy_in=ExceptionResponse::DIE, MapRotatableGroups map_chemfe_rotators=MapRotatableGroups::NO, PrintSituation expectation_in=PrintSituation::OPEN_NEW, StopWatch *timer_in=nullptr) (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(const SystemCache &original)=default	stormm::mm::SystemCache
SystemCache(SystemCache &&original)=default (defined in stormm::mm::SystemCache)	stormm::mm::SystemCache